學院擁有海洋科學“學士-碩士-博士-博士后”完整人才培養體系，并設有海洋科學、海洋技術、環境科學與工程和生態學等4個本科專業，其中海洋技術入選首批國家級一流本科專業建設點，海洋科學入選上海市一流本科專業建設點；環境科學與工程、生態學一級學科碩士點和資源與環境專業碩士點。學院建設教育部“111”創新引智基地、上海深淵科學工程技術研究中心、上海市深淵生物圈前沿科學研究基地、上海市河口海洋測繪工程技術研究中心、上海港口與近海生態環境知識服務平臺、上海市教委“深海極端環境與生物資源”戰略創新團隊、上海市海洋科學與技術實驗教學示范中心等國家級和省部級平臺，并與自然資源部共建海洋生態監測與修復技術重點實驗室。
現有教職工131人，其中專任教師94人，專任教師中正高級職稱27人、副高級職稱47人，中級職稱20人。學院圍繞極端海洋過程和水域生態治理等重點領域開展相關研究，涌現了一批心懷國家需求和人民福祉的科學家，現有國務院政府津貼2人、國家級人才4人、教育部新世紀優秀人才1人，上海市東方學者4人、上海青年東方學者3人、上海市曙光學者4人。
學院將按照生態文明建設總體布局，堅持“四個面向”，積極對接海洋強國、鄉村振興、長三角一體化等國家戰略，以學科建設為抓手，形成了“濱海-近海-深遠海-極地”的地球生命系統演化發展路線，以極端海洋過程和水域生態系統與生物資源為重點領域，聚焦河湖、江海、深淵、冷泉和極地的生命過程和元素循環、氣候變化與生物資源，突破深海極端環境保真采樣和原位觀測，攻克水域生態治理與生態修復關鍵技術；提升科研創新能力，以國家一流本科建設為重點，提升人才培養質量，提升學科影響力和貢獻度，努力建設國內先進，國際有影響力的新型海洋學院。
學院徽識
釋義：
1. 標志采用“字母+元素”構成方式，配色采用藍色(海洋色)和黃綠漸變色(生態色)，體現學院海洋科學與生態環境主題特色，突出學院發展方向。
2. 變體字母O代表海洋學(Oceanography)，融入的兩個變體字母E分別代表生態(Ecology)和環境(Environment)，波浪形的變體字母S代表科學（Science）,構成海洋科學與生態環境學院（COLLEGE OF OCEANOGRAPHY AND ECOLOGICAL SCIENCE）。
3. 字母E中間部分平滑過渡，與下方等間距的平行波浪線條形象象征海洋。
4. 中間帶經緯線的球體象征地球,字母E包圍兩側，形似兩人拉手環抱地球側視圖，寓意精誠合作保護人類共同賴以生存的生態家園。
5.地球上縱橫交錯的經緯線形似劃過天宇的衛星軌跡，寓意科學技術進步。
