（一）辦公室

　　負責文電、會務、機要、檔案等機關日常運轉和綜合協調工作；承擔政務信息、政務公開、保密、宣傳、信訪、政務督查工作；負責局機關行政后勤工作；協調水利突發事件應急管理工作。

　　（二）編制人事科

　　負責局機關和直屬事業的機構編制和人事工資、勞動保障管理和教育培訓工作；承辦全市水利行業、局屬單位的職稱評聘工作；負責水利體制改革的有關工作。

　　（三）水政水資源科

　　依據國家水利法律法規，制定全市水利工作政策；承辦普法教育工作；承擔機關有關規范性文件的合法性審核工作；指導水利行政許可工作并監督檢查；負責水政監察和水行政執法，協調監督水土保持和漁政執法工作；協調縣際重大水事糾紛；承辦行政復議、行政應訴、行政賠償及其他法律事務。

　　（四）規劃基建科

　　擬定全市水利發展規劃，組織編制市內流域水利綜合規劃、專業規劃和專項規劃；負責水利固定資產投資有關項目建議書、可行性研究報告及初步設計等前期工作的管理和審查上報工作；負責市內水利工程建設項目合規性審查工作。編制上報年度基本建設計劃；指導水利基本建設工程建設管理；指導水利建設市場的監督管理；負責跨縣和重點水利工程建設管理工作。組織開展對全市水利基本建設項目進行稽察、監督；受理工程建設舉報，組織對水利建設項目違規違紀事件的調查。編制全市水利科學技術發展規劃；組織貫徹水利行業技術標準、規程、規范并監督實施；組織實施水利科學技術研究、技術引進和科級推廣；組織水利科技成果鑒定；組織指導節水技術示范應用。

　　（五）計劃財務科

　　編制市級水利部門預決算；承擔市級水利資金和直屬單位國有資產的監督管理工作，依照有關法律法規負責全市水利規費征收；承擔機關財務管理。負責財務、統計人員培訓工作，指導直屬單位的財務管理工作；提出有關水利價格、收費、信貸的建議；提出全市水利固定資產投資規模和方向建議；編制全市水利基本建設項目投資計劃；承擔水利綜合統計。

　　（六）水庫管理科

　　負責編制全市水庫工程改造規劃；指導全市水庫工程安全運行和維護管理；組織指導全市水庫的安全監督工作；組織實施水庫的除險加固、歲修及應急處理工程；指導全市水庫工程的供水管理工作。

　　（七）農村水利科

　　負責全市農村水利工作。提出全市農村水利發展規劃及政策建議；負責大中型灌溉工程建設和管理；指導小型灌溉工程建設與管理；指導農村水利社會化服務體系建設；負責全市水利員隊伍管理。

　　（八）供水排水科

　　負責全市農村供水工作。編制全市農村飲水安全發展規劃；組織實施農村飲水安全工程建設及管理工作，擬定有關規范、標準和規章制度；研究提出鄉（鎮）供水、排水和農村飲水政策；按權限負責農村飲水供水工程設計上報和審批工作。

　　（九）防汛抗旱辦公室

　　承辦市防汛抗旱指揮部的日常工作；組織、協調、監督、指導全市防汛抗旱工作；負責編制全市防汛預案，按規定職權對大、中型水庫和重要水利工程組織實施防汛抗旱調度；負責全市河流行洪安全。

　　（十）水土保持科

　　承辦市水土保持委員會的日常工作；負責全市水土保持工作，組織編制水土保持規劃并監督實施，承擔水土流失綜合防治工作；負責開展水土保持監督執法工作；審核和上報開發建設項目、水土保持方案并監督實施，按規定權限負責對開發建設項目水土保持方案的審批；組織水土流失監測、預報并公告；負責全市水土流失補償費和治理費的征收和管理。

　　（十一）水產漁政科

　　研究擬定全市漁業發展規劃、技術進步措施、政策；對有關漁業法律、法規實施執法監督；指導全市漁業生產結構和布局調整；指導漁業資源、漁業水域生態環境的保護和管理，并負責水生野生動植物管理；行使漁船檢驗和漁政、漁港監督管理權；組織協調漁業生產、科研、技術推廣、水產品質量安全監測工作。

　　（十二）水電河道科

　　指導全市農村水能資源開發和水電站安全監督工作，指導全市農村電氣化和小水電代燃料工作。指導市管河流治理、河岸灘涂的開發及保護利用；負責全市河道采砂管理；審定入河排污口設置。協調解決河道水事糾紛，負責河道工程維護管理費的征收。

　　（十三）節約用水辦公室

　　負責水資源統一管理保護和節約用水工作，指導全市計劃用水和節約用水工作。