北京市生態環境保護科學研究院（以下簡稱北京市環科院）是全國第一家從事環境保護的科研機構。其前身是1957年成立的建工部市政研究所，1973年改名為北京市環境保護科學研究所，1994年改為北京市環境保護

北京市環科院現有職工300余人，其中，研究員及教授級高級工程師17人、副研究員及高級工程師74人、先后享受國務院政府津貼20人次，獲國家級、市級突出貢獻專家10人次。作為我國首批有權授予環境工程碩士學位的單位，歷年來北京市環科院已培養碩士研究生140余人。2013年經批準設立博士后科研工作站。

北京市環科院下設：城市生態環境研究所、環境規劃與政策研究所、大氣環境與污染防治研究所、水生態環境研究所、土壤環境與污染場地修復研究所、固體廢物污染防治研究所、污染源研究中心、環境分析測試中心、環境工程技術研究中心、環境技術咨詢所、綠色發展與智慧環保技術中心等專業部門。

以北京市環科院為依托單位的工程中心有：國家城市環境污染控制工程技術研究中心（科學技術部）、國家環境保護工業廢水污染控制工程技術（北京）中心（生態環境部）；北京市重點實驗室有：污染場地風險模擬與修復北京市重點實驗室、城市大氣揮發性有機物污染防治技術與應用北京市重點實驗室、城市環境污染控制技術研發北京國際科技合作基地。

北京市環科院具有國家發改委頒發的生態建設和環境工程咨詢單位甲級資信證書。北京市發改委頒發的市政公用工程乙級資信證書。

經過在我國環保戰線近60年的積累與發展，北京市環科院在政策法規制定、污染防治技術研發與設計、生態工程建設、區域環評規劃、成果轉化與產品開發等方面均取得了豐碩的成果。其中，獲得國家級各種科技獎勵20余項，獲省（部）級科技獎勵170余項，取得專利、軟件著作權200余項，并且多次在北京市科研院所“改革與發展”考評中獲得一、二等獎勵。

多年來，北京市環科院承擔并完成了大量環境治理與管理急需的科研項目，開發出多種實用化技術，為改善首都環境質量，為環境管理決策提供了重要的技術支持與服務。迄今為止，北京市環科院累計完成環境影響評價3800余項，各類環境科學與環境技術方面的研究項目近2000項，在全國近30個省（市）自治區完成治理工程1800余項。