太湖流域是中國經濟最發達、人口最密集、最具發展潛力的區域之一，也是人與自然矛盾最突出的地區之一。目前，太湖流域水資源保護依然存在一些矛盾與難點。在即將召開的2013年兩會上，中國民主同盟中央委員會將針對太湖流域人與自然突出矛盾提出整治議案。
針對其人口眾多、經濟發展產生大量污染；入河污染物總量遠遠超過流域納污能力；污染治理受技術、資金以及土地制約，尤其是農村面源與城市面源治理難度大；現治理模式中存在著污水外排導致近海污染現象等關鍵問題，民盟提案建議：
第一、繼續推進產業結構調整，落實太湖流域管理條例。這要求繼續推進產業結構的優化升級，減輕水資源水環境壓力，促進太湖流域經濟社會發展和環境保護協調。具體的措施包括：江蘇、浙江、上海需進一步完善污水管網處理建設，進一步加強城市街道、路面的環境衛生建設，減少地面污染物累積；加大農村面源治理，指導農民科學使用化肥，加大農村居民生活污水處理力度。
第二、加強監測與監測數據共享，研究標準銜接，推進不同部門之間的合作。目前，監測部門眾多，然而監測數據尚未共享，部分數據因時間、位置不同結果不一致，造成混亂；另一方面，各單位因監測能力有限，尚不能按規定全面監測，監測頻次不夠，這需要推進不同部門間的合作與交流，充分共享監測數據和信息，全面開展水源地的有毒有機物監測。還要強化流域與區域管理，加強省界水環境保護和流域功能區達標考核，完善水資源保護體制，理順流域與區域管理關系，加強水利、環保部門進一步協作。
第三、加快推進水利工程建設。水環境治理中污染治理是根本，但污染治理到一定程度，污染物進一步削減難度很大，太湖流域入河污染物總量在很長時間里將遠遠超過納污能力。因此，進一步推進太湖流域水資源綜合治理的主要手段之一，是以水利工程通過骨干河道調度，引長江水入太湖及流域提高水環境容量，加快水體流動提高自凈能力。水利引排工程前期工作周期較長，各種審批手續和程序繁多，項目協調和實施難度較大，需進一步加快推進，開展流域調度運行設計，提高水環境容量，加快水體流動。
第四在于統籌河湖海關系，進一步關注近海海域的水質保護，加強長江保護。
長江承接整個流域上游來水，其上游匯集的污染物，一大部分仍將輸送到河口地區，影響長江口水質。同時，污染物總量超過納污容量極限是太湖流域水質差的根本原因，污染外排需認真加以研究和監管。想要解決這個問題就應加強綜合生態監測評價，推進長江、內河、近海聯動污染治理工作，減少陸源污染對海洋環境的影響。需平衡河湖納污和海洋納污，統籌研究流域水功能區目標實現與近海水質保護間的關系。
